Неизменной осталась общая структура миссии, которая стала более детализированной. Среди новых изобретений был продемонстрировано творенье Леонардо да Винчи – дельтаплан, который набирал высоту с помощью пылающих костров города. На нем главный герой Эцио мог не только парить в воздухе, но и сражаться со своими соперниками.
На суше у ассасина появились новые приемы: сражаться с врагами, используя одновременно оружие в двух руках; перехватывать оружие; при желании избегать поединка, применяя дымовую гранату.